เนื่องจากปัญหาในซอฟต์แวร์ Quartus® II เวอร์ชั่น 11.0 SP1 คุณอาจเห็นคําเตือนที่สําคัญนี้บนอุปกรณ์รับส่งสัญญาณ Stratix® V แม้ว่า IP PHY ที่กําหนดเองและคอนโทรลเลอร์การกําหนดค่าใหม่จะมีการเชื่อมต่ออย่างถูกต้อง
ปัญหานี้จะได้รับการแก้ไขในซอฟต์แวร์ Quartus II เวอร์ชันในอนาคต