มีปัญหาที่ทราบกันดีเกี่ยวกับการแปลงไฟล์โปรแกรมแปลงไฟล์ SRAM Object (.sof) จากซอฟต์แวร์ Quartus® II เวอร์ชั่น 12.0 ถึง 12.1sp1 เปิดใช้งาน การตรวจสอบ Disable EPCS ID ตั้งแต่เวอร์ชัน 12.0 ถึง 12.1sp1 ซึ่งทําให้เกิดปัญหากับการฝึกอบรมลิงก์และโหลดภาพคอร์
หากต้องการเขียน karound ปัญหานี้ในซอฟต์แวร์ Quartus II เวอร์ชัน 12.0 ถึง 12.1 sp1 ให้ไปที่แท็บขั้นสูงของหน้าต่างแปลงไฟล์โปรแกรมและตรวจสอบช่องทําเครื่องหมายที่ปิดใช้งานการตรวจสอบ ID EPCS
ในซอฟต์แวร์ Quartus II เวอร์ชัน 13.0 ขึ้นไป จะมีการตั้งค่าการตรวจสอบปิดใช้งาน EPCS ID อย่างถูกต้อง
ปัญหานี้ได้รับการแก้ไขในซอฟต์แวร์ Quartus® II เวอร์ชั่น 14.0