เนื่องจากปัญหาที่ทราบในซอฟต์แวร์ Quartus® II เวอร์ชั่น 15.0 การจําลองการออกแบบตัวอย่าง IP JESD204B อาจล้มเหลวพร้อมข้อความต่อไปนี้หากสร้างในโหมด Soft PCS :
# Pattern Checker: ไม่พบข้อมูลที่ถูกต้อง!
# JESD204B Tx Core: พบข้อผิดพลาดของลิงก์ Tx!
# JESD204B Rx Core: OK!
# TESTBENCH_FAILED: ซิมล้มเหลว!
ความล้มเหลวนี้เกิดขึ้นเนื่องจากการตั้งค่าPMA_WIDTHใน ATX PLL ถูกตั้งค่าไม่ถูกต้องสําหรับการออกแบบตัวอย่างโหมด Soft PCS
ปัญหานี้ได้รับการกําหนดเวลาให้แก้ไขในซอฟต์แวร์ Quartus II เวอร์ชันในอนาคต