เนื่องจากปัญหาในซอฟต์แวร์ Quartus® II เวอร์ชั่น 10.1 และใหม่กว่า ไฟล์ pin-out (.pin) ที่สร้างขึ้นสําหรับอุปกรณ์ STRATIX® IV GT แสดงพิน CONF_DONE และ nSTATUS เป็น GND* อย่างไม่ถูกต้อง
ปัญหานี้ได้รับการแก้ไขเริ่มต้นด้วยซอฟต์แวร์ Quartus II เวอร์ชัน 11.0