มีปัญหาที่ทราบกันดีเกี่ยวกับ XAUI PHY IP ที่ความกว้างของพอร์ตของสัญญาณ "rx_recovered_clk" ใน HDL ที่สร้างขึ้นจาก MegaWizard™ เป็นความกว้างที่ไม่ถูกต้อง ความกว้างจะกว้าง 3 บิตเมื่อควรเป็น 4
ปัญหานี้ถูกนํามาใช้ใน Quartus® II v11.0 และ v11.0sp1 แต่ได้รับการแก้ไขเป็น v11.1 อุปกรณ์ที่ได้รับผลกระทบประกอบด้วยตัวแปร Stratix® IV, Arria® II, Cyclone® IV และ HardCopy® IV ทั้งหมดที่มีตัวรับส่งสัญญาณ
การแก้ไขปัญหาสําหรับ Quartus II v11.0 คือการเปลี่ยนความกว้างเป็น 4 บิตด้วยตนเอง การแก้ไขปัญหานี้ยังใช้ได้สําหรับ Qaurtus II v11.0sp1 อย่างไรก็ตาม มีโปรแกรมแก้ไขที่สามารถนําไปใช้กับ Quartus II v11.0sp1 โปรแกรมแก้ไขนี้สามารถดาวน์โหลดได้โดยใช้ลิงก์ต่อไปนี้:
ซอฟต์แวร์ Quartus II เวอร์ชัน 11.0SP1 patch 1.32 สําหรับ Windows
ซอฟต์แวร์ Quartus II เวอร์ชัน 11.0SP1 patch 1.32 สําหรับ Linux
ซอฟต์แวร์ Quartus II เวอร์ชัน 11.0SP1 ReadMe สําหรับโปรแกรมแก้ไข 1.32