เมื่อใช้ชุดเครื่องมือดีบัก EMIF บนการออกแบบคอนโทรลเลอร์หน่วยความจําที่ใช้ UniPHY ในซอฟต์แวร์ Quartus® II เวอร์ชั่น 12.0 คุณอาจพบข้อผิดพลาดภายในที่ระบุข้างต้น ปัญหาเกิดจากความขัดแย้งกันระหว่างทรัพยากรของ Serial Flash Loader และชุดเครื่องมือดีบัก EMIF
ปัญหานี้ได้รับการแก้ไขเริ่มต้นด้วยซอฟต์แวร์ Quartus II เวอร์ชัน 12.1 สําหรับซอฟต์แวร์ Quartus II รุ่นก่อนหน้า การแก้ปัญหาคือการถอดตัวโหลดแฟลชซีเรียลออกจากการออกแบบเมื่อใช้ชุดเครื่องมือดีบัก EMIF