เนื่องจากปัญหาในซอฟต์แวร์ Quartus® II เวอร์ชั่น 12.0sp2 และใหม่กว่า สัญญาณนาฬิกาที่ไม่มีข้อจํากัดสามตัวอาจปรากฏใน TimeQuest Timing Analyzer เมื่อสร้างคอนโทรลเลอร์ DDR3 ที่มี UniPHY สําหรับอุปกรณ์ Arria V ST, GX และ GT ชื่อพินเอาต์พุตสัญญาณนาฬิกาจะลงท้ายด้วยต่อไปนี้:
|dqs_enable_ctrl~DFFEXTENDDQSENABLE
นาฬิกาที่ไม่มีข้อจํากัดเหล่านี้สามารถละเลยได้อย่างปลอดภัย คําเตือนจะถูกลบออกในซอฟต์แวร์ Quartus II เวอร์ชันในอนาคต