เมื่อทําการจําลอง RTL ของฟังก์ชัน ALTPLL ความละเอียดขั้นตอนการเปลี่ยนเฟสอาจแตกต่างจากค่าที่คาดไว้เมื่อตั้งค่าประเภท PLL เป็น "อัตโนมัติ" โดยการเปิดตัวเลือก เลือกประเภท PLL โดยอัตโนมัติ ใน ALTPLL MegaWizard® Plug-In Manager ในกรณีนี้ โมเดลการจําลองอาจเลือกความถี่ VCO ที่แตกต่างจากฟังก์ชัน ALTPLL และขั้นตอนไม่ถูกต้อง
ปัญหานี้ไม่มีผลต่อการจําลองระดับเกตโดยใช้ฟังก์ชัน ALTPLL
สามารถกําหนดความละเอียดของขั้นตอนการเปลี่ยนเฟสที่ถูกต้องได้ด้วยการคํานวณ โปรดดูที่: คู่มือผู้ใช้งานเมก้าฟังก์ชันลูปแบบ Phase-Locked (ALTPLL) (PDF) ในบทการกําหนดค่าเฟสแบบไดนามิกใหม่ จากคู่มือผู้ใช้นี้ ขั้นตอนการเปลี่ยนเฟสที่ดีที่สุดคือความถี่ VCO ของ PLL ที่ 1/8