เมื่อจําลองการออกแบบตัวอย่างของคอนโทรลเลอร์ UniPHY ด้วยตัวเลือกเฉพาะ PHY บางพอร์ตในคอนโทรลเลอร์ *_e0_c0 instance จะไม่เชื่อมต่ออยู่ ทําให้การจําลองล้มเหลว
การแก้ไขปัญหาคือการผูกพอร์ตอินพุตที่ไม่เชื่อมต่อทั้งหมดให้เป็นศูนย์ใน *_example_sim_e0_c0 อินสแตนซ์ของไฟล์ *_e0.v
ปัญหานี้ได้รับการแก้ไขในซอฟต์แวร์ Quartus® II เวอร์ชัน 13.1