เนื่องจากปัญหาเกี่ยวกับซอฟต์แวร์ Quartus® Prime Pro Edition ใน Linux ไฟล์ VHDL ที่มีขนาดใหญ่กว่า 16383 (16K) ในไฟล์แล้วเข้ารหัสด้วย encrypt_1735 อาจทําให้การคอมไพล์หยุดโดยไม่คาดคิดที่ขั้นตอนการวิเคราะห์และการสังเคราะห์
เพื่อหลีกเลี่ยงปัญหานี้ แฟ้มที่มีขนาดมากกว่า 16K ในขนาดแฟ้มต้องถูกแบ่งออกเป็นแฟ้มขนาดเล็กกว่า 16K ก่อนที่คุณจะเริ่มการเข้ารหัส
นอกจากนี้คุณสามารถใช้ซอฟต์แวร์ Quartus® Prime Pro Edition กับ Windows เพราะไม่มีข้อจํากัดนี้
ปัญหานี้ถูกกําหนดให้ได้รับการแก้ไขในซอฟต์แวร์ Quartus® Prime Pro Edition ในอนาคต