ซอฟต์แวร์ Quartus II ต้องใช้ไดเรกทอรีที่มีไฟล์ปฏิบัติการ ModelSim เช่น vlog, vcom และ vsim เพื่อให้อยู่ในตัวแปรสภาพแวดล้อม PATH
ตัวอย่างเช่น ตัวแปร PATH ต้องรวมไดเรกทอรีต่อไปนี้สําหรับซอฟต์แวร์ ModelSim SE และเครื่องมือ ModelSim-Altera บนแพลตฟอร์มพีซี:
\win32 \win32aloem