เนื่องจากปัญหาในซอฟต์แวร์ Quartus® II เวอร์ชั่น 13.0 SP1 และก่อนหน้า คุณอาจพบว่าเมื่อทําการคอมไพล์หลายรายการพร้อมกันโดยใช้ Design Space Explorer (DSE) ในโหมดบรรทัดคําสั่ง จะมีการคอมไพล์พื้นฐานทั้งหมดก่อนที่จะคอมไพล์ข้อมูลเริ่มต้นอื่นๆ
ปัญหานี้เจาะจงในโหมดบรรทัดคําสั่งเพื่อให้สามารถแก้ไขปัญหาได้โดยใช้ DSE จาก GUI
ปัญหานี้ได้รับการกําหนดเวลาให้แก้ไขในซอฟต์แวร์ Quartus II เวอร์ชันในอนาคต