เนื่องจากปัญหาของตัวแก้ไขส่วนประกอบ Qsys ในเวอร์ชัน 12.0 และ 12.0sp1 จะมีเพียงไฟล์ระดับบนสุดเท่านั้นที่แสดงในแท็บไฟล์ ไฟล์โมดูลย่อยอื่นๆ จะหายไปเมื่อทําการแก้ไขส่วนประกอบแบบกําหนดเอง
เพิ่มไฟล์ที่สูญหายไปด้วยตนเองเมื่อทําการแก้ไขส่วนประกอบ
ปัญหานี้ได้รับการกําหนดเวลาให้แก้ไขในรุ่นในอนาคต