เนื่องจากปัญหาในซอฟต์แวร์ Quartus® II เวอร์ชัน 13.1 และก่อนหน้า ผู้ช่วยออกแบบจะไม่รายงานการละเมิดกฎเมื่อมีการเชื่อมต่อสัญญาณล็อกของ PLL โดยตรงกับการรีเซ็ตการลงทะเบียนที่ไม่ต่อเนื่อง
เมื่อใช้สัญญาณล็อกของ PLL เป็นรีเซ็ต ให้ซิงโครไนซ์สัญญาณไปยังโดเมนนาฬิกาปลายทางเพื่อให้แน่ใจว่าการวิเคราะห์เวลาอย่างถูกต้อง
ปัญหานี้มีกําหนดเวลาให้แก้ไขในซอฟต์แวร์ Quartus II ในอนาคต