Tรูปแบบไฟล์ .jam ไม่ได้จัดเก็บตัวเลือกการเขียนโปรแกรมใดๆ ที่เปิดอยู่ ใน Quartus® หน้าต่างโปรแกรมเมอร์ II. ในหน้าต่าง Quartus II Programmer ตัวเลือกการเขียนโปรแกรมจะถูกละเลยเมื่อสร้างไฟล์ .jam ดังนั้นไฟล์ .jam จึงไม่มีความสามารถที่อนุญาตให้ผู้ใช้เลือกตัวเลือก เช่น โปรแกรม ตรวจสอบ ตรวจสอบ ว่างเปล่า หรือลบข้อมูลบนอุปกรณ์แต่ละเครื่อง
เมื่อดําเนินการไฟล์ .jam ผ่าน Jam STAPL Player คุณสามารถเลือกได้ว่าจะใช้การดําเนินการใด อย่างไรก็ตาม หากเป็นไฟล์ .jam หลายอุปกรณ์ การดําเนินการที่คุณเลือกจะนําไปใช้กับอุปกรณ์ทั้งหมดในห่วงโซ่ JTAG เนื่องจากมีไฟล์ข้อมูลสําหรับแต่ละอุปกรณ์ในไฟล์ .jam แบบหลายอุปกรณ์