เนื่องจากปัญหาในคอนโทรลเลอร์ซอฟต์รีเซ็ต เมื่อมีการใช้การรีเซ็ตแบบ Hot LTSSM จะไม่ผ่านทุกสถานะที่คาดไว้เมื่อเริ่มต้นการรีเซ็ตแบบ Hot
ปัญหานี้สามารถแก้ไขได้ด้วยรหัสซอฟต์ลอจิกต่อไปนี้ในไฟล์ altpcie_rs_serdes.v ใกล้บรรทัดที่ 526:
exits_r
ปัญหานี้ได้รับการแก้ไขในซอฟต์แวร์ Intel® Quartus® เวอร์ชั่น 14.0