เมื่อใช้ Altera® IP Compiler สําหรับ PCI Express® การขัดจังหวะจะไม่ทํางานสําหรับการกําหนดค่าทั้งหมดของ IP ยกเว้นสําหรับตัวแปร dword เดียวที่สมบูรณ์เท่านั้นหากพอร์ต CRA ไม่ได้เชื่อมต่อ
การลงทะเบียนที่ขัดจังหวะและตรรกะการควบคุมจะถูกนําไปใช้ก็ต่อเมื่อใช้พอร์ต CRA ซึ่งโดยทั่วไปพอร์ต CRA จะถูกเชื่อมต่อกับ BAR เพื่อให้โฮสต์สามารถเข้าถึงอินเทอร์เฟซนี้ได้