ปัญหาสำคัญ
Qsys ไม่รองรับฟังก์ชัน MegaCore Alteraทั้งหมด ตัวอย่างเช่น Qsys ไม่รองรับ 10GBASE-R PHY, ASI, CPRI, FFT, FIR COMPILER, ฟังก์ชัน PCI EXPRESS, REED SOLOMON, VITERBI และ XAUI PHY MegaCore
ใช้ตัวจัดการปลั๊กอิน MegaWizard หรือ SOPC Builder (หากรองรับ) สําหรับรายการฟังก์ชัน MegaCore ที่รองรับ Qsys ทั้งหมด โปรดดู ไปยังแท็บ ไลบรารีส่วนประกอบ ใน Qsys